Sumários

Aula TP12-4

17 Outubro 2018, 08:00 Carlos Alberto Rodrigues Fernandes

Software MEGA: Distâncias genéticas; teste D de Tajima.
Software Arlequin: Fst; Mismatch Distributions; Testes de Fu e Tajima.


NGS- Aplicações

16 Outubro 2018, 15:30 Maria Manuela Gomes Coelho de Noronha Trancoso

Análise de resultados da NGS.

Aplicações gerais, em particular em organismos não-modelo. eDNA e Metagenómica.

RNA- seq. Caso estudo - Adaptação e alterações globais, 


Aula TP11-4

15 Outubro 2018, 08:00 Carlos Alberto Rodrigues Fernandes

Software MEGA: Distâncias genéticas; teste D de Tajima.
Software Arlequin: Fst; Mismatch Distributions; Testes de Fu e Tajima.


Sequenciação de 2ª e 3ª geração

11 Outubro 2018, 16:30 Maria Manuela Gomes Coelho de Noronha Trancoso

Solid (Applied Biosystem).  Comparação entre as plataformas de 2ª geração. Exemplos de estudos.

Sequenciação de 3ª geração. Pacific Biosciences and Nanoporo. Vantagens e desvantagens das plataformas de 1ª e 2ª geração.

Desafios ligados à NGS- problemas e soluções.

 


Aula TP12-3

10 Outubro 2018, 08:00 Carlos Alberto Rodrigues Fernandes

Software MEGA. Selecção de modelos de substituição nucleotídica. Reconstrução de árvores filogenéticas. Teste de relógio molecular.