Introdução NGS

9 Outubro 2018, 15:30 • Maria Manuela Gomes Coelho de Noronha Trancoso

AFLPs – obtenção, vantagens e desvantagens.

SNPs. Obtenção e genotipagem. Aplicações gerais. 

 Next generation sequencing.

Sequenciação na plataforma  454 – breve referência.

Aula TP11-3

8 Outubro 2018, 08:00 • Carlos Alberto Rodrigues Fernandes

Software MEGA. Selecção de modelos de substituição nucleotídica. Reconstrução de árvores filogenéticas. Teste de relógio molecular.

Outros marcadores

4 Outubro 2018, 16:30 • Maria Manuela Gomes Coelho de Noronha Trancoso

Microssatélites: Principais modelos mutacionais.  Análise de resultados. Exemplos de estudos de genética populacional com microssatélites.

Outros marcadores –RFLPS: nº e tamanho dos fragmentos. Aplicações.

Aula TP12-2

3 Outubro 2018, 08:00 • Carlos Alberto Rodrigues Fernandes

Bases de dados públicas de sequências (GenBank, BLAST, ENSEMBL). Desenho de primers (Primer3).

nDNA e microssatélites

2 Outubro 2018, 15:30 • Maria Manuela Gomes Coelho de Noronha Trancoso

nDNA- complementaridade relativamente ao mtDNA- estudos de sequenciação em Squalius.

Microssatélites: definição,vantagens e problemas. Importância destes marcadores e aplicações gerais. Genotipagem.