Sumários
Mapeamento genético
3 Dezembro 2019, 15:30 • Patricia Beldade
Variação fenotípica e seus componentes. QTLs. Princípio do mapeamento genético. Mapeamento baseado em cruzamentos e em desequilíbrio de linkage. Associação entre genótipos e fenótipos. Testar marcadores em genes candidatos versus distribuídos por todo o genoma. Exemplo do princípio e procedimento de um teste da contribuição dum gene candidato para variação fenotípica num caracter quantitativo.
Associação entre marcadores
2 Dezembro 2019, 09:00 • Patricia Beldade
Linkage genético e desequílibrio de linkage: definições, propriedades, medidas e aplicações. Distância genética e frequência de recombinação. Construção de mapas genéticos. Relação entre frequências haplotípicas e frequências alélicas numa população. Exercício.
Marcadores neutros e não-neutros
28 Novembro 2019, 12:00 • Patricia Beldade
Mutação como força geradora de variabilidade genética. Taxa e efeitos de mutações. Variantes neutros e não neutros relativamente à selecção. Manutenção de polimorfismo. Substituições silenciosas e não sinónimas em sequência codificante. Teoria neutra e expectativas para taxas de substituições silenciosas (dS) e não-sinónimas (dN). Evolução molecular. Assinaturas de selecção (ou outras forças evolutivas) em dados de sequências nucleotídicas ao longo do genoma: dN/dS, Fst outliers, aumento local de LD, redução local de variabilidade.
Preparação dos projectos
27 Novembro 2019, 09:00 • Patricia Beldade
Organização do horário das apresentações de grupo na última semana de aulas. Exemplos de áreas e tópicos em que se podem aplicar marcadores genéticos. Impacto das alterações climáticas. Evolução urbana. Catalogação e caracterização de biodiversidade. Bases genéticas da adaptação. Medicina evolutiva. Tópicos para além da ecologia e evolução. Marcadores para além de variantes em sequência do DNA. Etapas na preparação do projecto.
Associação entre marcadores e sua aplicação
26 Novembro 2019, 15:30 • Patricia Beldade
Conclusão do tópico da aula anterior sobre medidas e factores que afectam a estrutura da diversidade genética em populações. Linkage genético e desequilíbrio de linkage (LD). Definição, exemplos e medidas de LD. Factores que causam LD: selecção, deriva, admixture. Factores que removem LD: reprodução sexuada e recombinação. Quebra de LD com distância genética. LD blocks para vários pares de SNPs. Porquê estudar LD.