Especiação por hibridação

29 Outubro 2019, 15:30 • Maria Manuela Gomes Coelho de Noronha Trancoso

Dinâmica das zonas hibridas - exemplo em bogas.

Especiação homoplóide. Distinção entre evidências de polimorfismo ancestral e hibridação. Fatores inerentes è especiação por hibridação. 

Exemplo em golfinhos. 

Marcadores e aplicações

28 Outubro 2019, 09:00 • Patricia Beldade

Continuação e correcção do exercício da aula anterior sobre sumário e análise de dados de diferentes tipos de marcadores. Preparação do projecto final: explicação do exercício e organização dos estudantes em grupos. Aplicação de marcadores em diferentes níveis de análise e tipos de perguntas. Explicação dum exercício para apresentar na aula 9.

Introdução Hibridação

24 Outubro 2019, 12:00 • Maria Manuela Gomes Coelho de Noronha Trancoso

RNA- seq. Caso estudo com base em NGS - Adaptação e alterações Climáticas.

Hibridação, introgressão e zonas híbridas. Dificuldades na deteção dos hibridos. Modelos das zonas híbridas: evolutivo e de tensão.

Dinâmica das zonas hibridas.

Visualização e dados de marcadores moleculares

23 Outubro 2019, 09:00 • Patricia Beldade

Tipos de marcadores e exemplos: morfológicos, alozimas, baseados em DNA (incluindo AFLPs, microsatellites, SNPs). Propriedades dos marcadores; incluindo: dominantes ou co-dominantes, níveis de polimorfismo, facilidade de desenvolvimento e genotipagem, necessidade ou não de informação sobre sequência nucleotídica, requesitos sobre qualidade e quantidade de DNA. Exemplos detalhados de dois “polimorfismos de tamanho” (detecção por electroforese com base em tamanho de fragmentos) cujo ensaio envolve PCR mas diferem em dominância ou co-dominância e necessidade ou não de informação sobre sequência nucleotídica: AFLPs e microsatellites. Exercícios de leitura de polimorismo em RFLP, AFLP e microsatellites e entrada dos dados correspondentes.

Aplicações NGS

22 Outubro 2019, 15:30 • Maria Manuela Gomes Coelho de Noronha Trancoso

Aplicações gerais, em particular em organismos não-modelo. WGS e RNA- seq. Exemplos de Aplicação de NGS.  eDNA e Metagenómica.