Visualização e dados de marcadores moleculares

21 Outubro 2019, 09:00 • Patricia Beldade

Tipos de marcadores e exemplos: morfológicos, alozimas, baseados em DNA (incluindo AFLPs, microsatellites, SNPs). Propriedades dos marcadores; incluindo: dominantes ou co-dominantes, níveis de polimorfismo, facilidade de desenvolvimento e genotipagem, necessidade ou não de informação sobre sequência nucleotídica, requesitos sobre qualidade e quantidade de DNA. Exemplos detalhados de dois “polimorfismos de tamanho” (detecção por electroforese com base em tamanho de fragmentos) cujo ensaio envolve PCR mas diferem em dominância ou co-dominância e necessidade ou não de informação sobre sequência nucleotídica: AFLPs e microsatellites. Exercícios de leitura de polimorismo em RFLP, AFLP e microsatellites e entrada dos dados correspondentes.

Visita Facility

17 Outubro 2019, 12:00 • Maria Manuela Gomes Coelho de Noronha Trancoso

Análise quantitativa e comparativa de sequências

16 Outubro 2019, 09:00 • Patricia Beldade

Estatísticas descritivas de sequências. Composição em nucleótidos ou aminoácidos. Uso de codões alternativos. Comparações de sequências de diferentes origens. Polimorfismos. Tipos de substituições de nucleótidos. Cálculo e utilidade de matrizes de distâncias genéticas. Modelos de substituições. Exercícios no programa MegaX.

NGS - 3ª geração

15 Outubro 2019, 15:30 • Maria Manuela Gomes Coelho de Noronha Trancoso

Sequenciação de 3ª geração. Pacific Biosciences and Nanoporo.

Vantagens e desvantagens das plataformas de 1ª e 2ª geração.

Desafios ligados à NGS- problemas e soluções.

Análise de resultados da NGS em DNA e RNA.

Tratamento bioinformático dos dados de NGS

Análise quantitativa e comparativa de sequências

14 Outubro 2019, 09:00 • Patricia Beldade

Estatísticas descritivas de sequências. Composição em nucleótidos ou aminoácidos. Uso de codões alternativos. Comparações de sequências de diferentes origens. Polimorfismos. Tipos de substituições de nucleótidos. Cálculo e utilidade de matrizes de distâncias genéticas. Modelos de substituições. Exercícios no programa MegaX.