NGS

10 Outubro 2019, 12:00 • Maria Manuela Gomes Coelho de Noronha Trancoso

Introdução à NGS (Next generation sequencing).

Diferenças entre a sequenciação de 2ª e 3ª geração. Diferentes Platafomas.Preparação das bibliotecas genómicas.

Sequenciação na plataforma  454 – breve referência.

Sequenciação em Hiseq (Illumina). Solid (Applied Biosystem) – Bibliotecas, amplificação e sequênciação (visualização de filmes sobre os procedimentos nestas plataformas). 

Repositórios públicos de sequências e ferramentas de análise

9 Outubro 2019, 09:00 • Patricia Beldade

Bases de dados de sequências e informações e ferramentas associadas. Ensemble (da EBI) e GenBan (da NCBI). Procura de sequências: identidade e homologias. Acesso a vários tipos de informação genética: sequência, localização cromossómica, expressão, variantes. Exercícios de utilização do GenBank: buscas, BLAST e ORF finder.

Outros marcadores nucleares

8 Outubro 2019, 15:30 • Maria Manuela Gomes Coelho de Noronha Trancoso

Outros marcadores –RFLPS: nº e tamanho dos fragmentos. Aplicações.

AFLPs – obtenção, vantagens e desvantagens.

SNPs. Obtenção e genotipagem. Aplicações gerais. 

Repositórios públicos de sequências e ferramentas de análise

7 Outubro 2019, 09:00 • Patricia Beldade

Bases de dados de sequências e informações e ferramentas associadas. Ensemble (da EBI) e GenBan (da NCBI). Procura de sequências: identidade e homologias. Acesso a vários tipos de informação genética: sequência, localização cromossómica, expressão, variantes. Exercícios de utilização do GenBank: buscas, BLAST e ORF finder.

Microssatélites

3 Outubro 2019, 12:00 • Maria Manuela Gomes Coelho de Noronha Trancoso

Microssatélites. Defunição. Vantagens e desvantagens do uso deste marcador. Principais modelos mutacionais. Genotipagem.  Análise de resultados. Exemplo de estudo de genética populacional com microssatélites.