Sumários
Alinhamento, consensus e software Geneious.
13 Outubro 2023, 09:00 • Maria Helena Machado Trindade de Donato
Alinhamento de sequências e sequência consensus. Identidade, similaridade e homologia, genes ortólogos e parálogos. Assemblagem e anotação de genomas.Identidade, similaridade e homologia, genes ortólogos e parálogos. Assemblagem e anotação de genomas. Apresentação do software bioinformático Geneious Apresentação do software bioinformático Geneious: ligação ao GenBank para pesquisa por genes e nucleótidos. Alinhamento de sequências e identificação de regiões de identidade. Desenho de primers para amplificação de genes específicos. Pesquisa de motivos característicos presentes em regiões conservadas.
Plataformas de NGS
13 Outubro 2023, 08:00 • Maria Helena Machado Trindade de Donato
Novas plataformas de sequenciação de genomas (NGS): Roche 454, Illumina e Nanopore; principais diferenças entre os vários métodos de sequenciação, vantagens e desvantagens de cada uma delas.
Métodos Biomoleculares utilizados na Genómica
11 Outubro 2023, 08:00 • Maria Helena Machado Trindade de Donato
Métodos Biomoleculares utilizados na Genómica. Revisão de alguns conceitos: De onde provém a variabilidade do genoma, com particular destaque para SNPs e InDel. A sequenciação pelo método Sanger.
Tecnologias utilizadas no estudo do RNA
9 Outubro 2023, 09:00 • Rita Zilhão
Tecnologias utilizadas no estudo do RNA: Metodologias e abordagens experimentais onde as moléculas de RNA são utilizadas como ferramentas de base para responder a questões biológicas específicas. Os diferentes pipos de RNA. Técnicas bioquímicas clássicas: transcrição in vitro, electrophoretic mobility shift assay (EMSA), super electrophoretic mobility assay, filter binding assay, nucleasse protection assay, run-on assay. Tecnologias mais actuais: imunoprecipitação de RNA (RIP) e RNA pull-down, RNA-assisted RNA chromatography. O processo biológico de RNA de interferência (RNAi). Mecanismo geral de RNAi. Tecnologia de RNAi – ferramentas e estratégias; análise funcional da acção de RNAi. Aplicações e exemplos da tecnologia de RNAi.
Tecnologias utilizadas no estudo do RNA
9 Outubro 2023, 08:00 • Rita Zilhão
Tecnologias utilizadas no estudo do RNA: Metodologias e abordagens experimentais onde as moléculas de RNA são utilizadas como ferramentas de base para responder a questões biológicas específicas. Os diferentes pipos de RNA. Técnicas bioquímicas clássicas: transcrição in vitro, electrophoretic mobility shift assay (EMSA), super electrophoretic mobility assay, filter binding assay, nucleasse protection assay, run-on assay. Tecnologias mais actuais: imunoprecipitação de RNA (RIP) e RNA pull-down, RNA-assisted RNA chromatography. O processo biológico de RNA de interferência (RNAi). Mecanismo geral de RNAi. Tecnologia de RNAi – ferramentas e estratégias; análise funcional da acção de RNAi. Aplicações e exemplos da tecnologia de RNAi.