Genómica 2

16 Outubro 2019, 10:00 • Maria Helena Machado Trindade de Donato

Teórica: Alinhamento de sequências e sequência consensus. Identidade, similaridade e homologia, genes ortólogos e parálogos. Assemblagem e anotação de genomas.Identidade, similaridade e homologia, genes ortólogos e parálogos. Assemblagem e anotação de genomas.

Teórico-Prática: Apresentação de do software bioinformático Geneious: ligação ao GenBank para pesquisa por genes e nucleótidos. Alinhamento de sequências e identificação de regiões de identidade. Desenho de primers para amplificação de genes específicos. Pesquisa de motivos característicos presentes em regiões conservadas.

Genómica 2

16 Outubro 2019, 09:00 • Maria Helena Machado Trindade de Donato

Teórica: Alinhamento de sequências e sequência consensus. Identidade, similaridade e homologia, genes ortólogos e parálogos. Assemblagem e anotação de genomas.Identidade, similaridade e homologia, genes ortólogos e parálogos. Assemblagem e anotação de genomas.

Teórico-Prática: Apresentação de do software bioinformático Geneious: ligação ao GenBank para pesquisa por genes e nucleótidos. Alinhamento de sequências e identificação de regiões de identidade. Desenho de primers para amplificação de genes específicos. Pesquisa de motivos característicos presentes em regiões conservadas.

Tecnologias utilizadas no estudo do RNA

14 Outubro 2019, 10:00 • Rita Zilhão

Tecnologias utilizadas no estudo do RNA: Metodologias e abordagens experimentais onde as moléculas de RNA são utilizadas como ferramentas de base para responder a questões biológicas específicas. Os diferentes pipos de RNA. Técnicas bioquímicas clássicas: transcrição  in vitro, electrophoretic  mobility shift  assay (EMSA) , super  electrophoretic mobility assay, filter binding assay, nucleasse protection assay, run-on assay. Tecnologias mais actuais: imunoprecipitação de RNA (RIP) e RNA  pull-down, RNA-assisted RNA  chromatography. O processo biológico de RNA de interferência (RNAi). Mecanismo geral de RNAi. Tecnologia de RNAi – ferramentas e estratégias; análise funcional da acção de RNAi. Aplicações e exemplos da tecnologia de RNAi. 

Tecnologias utilizadas no estudo do RNA

14 Outubro 2019, 09:00 • Rita Zilhão

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Tecnologias utilizadas no estudo do RNA: Metodologias e abordagens experimentais onde as moléculas de RNA são utilizadas como ferramentas de base para responder a questões biológicas específicas. Os diferentes pipos de RNA. Técnicas bioquímicas clássicas: transcrição in vitro, electrophoretic mobility shift assay (EMSA), super electrophoretic mobility assay, filter binding assay, nucleasse protection assay, run-on assay. Tecnologias mais actuais: imunoprecipitação de RNA (RIP) e RNA pull-down, RNA-assisted RNA chromatography. O processo biológico de RNA de interferência (RNAi). Mecanismo geral de RNAi. Tecnologia de RNAi – ferramentas e estratégias; análise funcional da acção de RNAi. Aplicações e exemplos da tecnologia de RNAi. 

Genómica 1

11 Outubro 2019, 09:00 • Maria Helena Machado Trindade de Donato

Métodos Biomoleculares utilizados na Genómica. Revisão de alguns conceitos: De onde provém a variabilidade do genoma, com particular destaque para SNPs e InDel. A sequenciação pelo método Sanger e novas plataformas de sequenciação de genomas (NGS): Roche 454, Illumina e Nanopore; principais diferenças entre os vários métodos de sequenciação, vantagens e desvantagens de cada uma delas.