Sumários

Análise quantitativa e comparativa de sequências

10 Outubro 2022, 08:30 • Patricia Beldade

Estatísticas descritivas de sequências. Composição em nucleótidos ou aminoácidos. Uso de codões alternativos. Comparações de sequências de diferentes origens. Polimorfismos. Tipos de substituições de nucleótidos. Cálculo e utilidade de matrizes de distâncias genéticas. Modelos de substituições. Exercícios no programa MegaX.

Tipos de DNA e sua utilização

6 Outubro 2022, 12:00 • Patricia Beldade

Tipos de DNA e suas propriedades principais. cDNA versus gDNA. aDNA e eDNA. ncDNA versus mtDNA. Complementaridade e princípio da sua utilização. Propriedades, vantagens e aplicações da utilização de mtDNA.

Análise de sequências

4 Outubro 2022, 15:30 • Patricia Beldade

Continuação da aula anterior: SNPs e sua importância. Análise de sequências. Alinhamentos e polimorfismos. Distâncias genéticas. DNA barcodes: definições, propriedades e aplicações. Identificação e catalogação de espécies via técnicas de DNA barcoding. Características e exemplos de “barcodes” para diferentes grupos taxonómicos. Princípio da análise e exemplos da sua utilização. 

Manuseamento de sequências e bases de dados

3 Outubro 2022, 08:30 • Patricia Beldade

Ferramentas de análise molecular em laboratório: sequenciação de Sanger, PCR, restricção. Uso na identificação e genotipagem de polimorfismos. Desenho de primers de PCR. Identificação de sites de reconhecimento de enzimas de restricção. Mapas de restricção. Bases de dados de sequências e informações e ferramentas associadas. Ensemble (da EBI) e GenBanK (da NCBI). Procura de sequências: identidade e homologias. Acesso a vários tipos de informação genética: sequência, localização cromossómica, expressão, variantes. Exercícios de utilização do GenBank: buscas, BLAST e ORF finder.

Sequenciação

29 Setembro 2022, 12:00 • Patricia Beldade

Continuação da aula anterior: marcadores AFLP e microsatélites. Métodos de obtenção de sequência nucleotídica. Sequenciação de Sanger (manual e automática) e NGS (introdução). Obtenção e processamento de sequências.