Sumários
SIM Sessão 3
4 Abril 2024, 09:00 • Francisco Rodrigues Pinto
Simulação do comportamento da via de NFkB em resposta a TNF - Parte 2
DEFM III: Desenho de ferramentas CRISPR/Cas9, confirmação por western blotting, PCR e sequenciação
4 Abril 2024, 09:00 • Federico Herrera Garcia
Nesta última sessão do módulo de desenho experimental e de ferramentas moleculares, fiz uma apresentação de 20 min sobre origem e fundamentos dos sistemas CRISPR/Cas9; e as diferenças entre os sistemas naturais de CRISPR e os que utilizamos para manipular genomas. Trabalhou-se a nomenclatura destes sistemas, e se mostraram duas ferramentas online que permitiam o desenho de RNAs guia a partir de sequências genómicas de interesse, nomeadamente Benchling e Vectorbuilder. Desenharam um vetor a expressar um RNA guia contra uma sequência de STAT3, a nuclease Cas9 e um marcador fluorescente para poder selecionar as células que incorporaram o sistema CRISPR por FACS. Depois desenharam primers para amplificar o local alvo do sistema CRISPR no genoma humano por PCR, e para sequenciar estes produtos de PCR. Analisaram cromatogramas de sequenciação e se mostrou como se podiam representar estas ferramentas/métodos/resultados num artigo.
SIM Sessão 2
22 Março 2024, 14:00 • João André Isidoro Miranda
| Análise de interações entre as vias de NF-κB e STAT3 |
SIM Sessão 2
22 Março 2024, 09:00 • João André Isidoro Miranda
| Análise de interações entre as vias de NF-κB e STAT3 |
SIM Sessão 1
21 Março 2024, 14:00 • João André Isidoro Miranda
| Simulação do comportamento da via de NF-κB em resposta a TNF-ɑ (parte 1) |