Sumários
T 05: Análise de sequências.
3 Outubro 2023, 15:30 • Patricia Beldade
Análise de sequências. Alinhamentos e polimorfismos. Distâncias genéticas. DNA barcodes: definições, propriedades e aplicações. Identificação e catalogação de espécies via técnicas de DNA barcoding. Características e exemplos de “barcodes” para diferentes grupos taxonómicos. Princípio da análise e exemplos da sua utilização.
TP 02 : Manuseamento de sequências e bases de dados
2 Outubro 2023, 14:00 • Patricia Beldade
Ferramentas de análise molecular em laboratório: sequenciação de Sanger, PCR, restricção. Uso na identificação e genotipagem de polimorfismos. Desenho de primers de PCR. Identificação de sites de reconhecimento de enzimas de restricção. Mapas de restricção. Bases de dados de sequências e informações e ferramentas associadas. Ensemble (da EBI) e GenBanK (da NCBI). Procura de sequências: identidade e homologias. Acesso a vários tipos de informação genética: sequência, localização cromossómica, expressão, variantes. Exercícios de utilização do GenBank: buscas, BLAST e ORF finder.
T 04 : Sequenciação & SNPs
28 Setembro 2023, 12:30 • Patricia Beldade
Continuação da aula anterior: microsatélites. Métodos de obtenção de sequência nucleotídica. Sequenciação de Sanger (manual e automática) e NGS (introdução). Obtenção e processamento de sequências. SNPs e sua importância.
TP 01 : Introdução e alinhamentos
28 Setembro 2023, 10:00 • Patricia Beldade
Objectivos da cadeira e das aulas TP. Calendarização e avaliação. Explicação do projecto. Programa das aulas. Polimorfismos e sua origem. Formatos FASTA e FASTQ. Códigos IUPAC. Alinhamentos de sequências e identificação de polimorfismos. SNPs e indels.
T 03 : Métodos de análise de DNA & marcadores RFLP, AFLP, SSR/STR
26 Setembro 2023, 15:30 • Patricia Beldade
Métodos de análise de DNA relevantes para a identificação e utilização de marcadores. Digestão com enzimas de restrição, amplificação por PCR. Marcadores que requerem ou não conhecimento da sequência do DNA. Detecção de fragmentos, RFLPs, AFLPs, microssatélites: definição, procedimento, propriedades, utilização.