Sumários

TP 02 : Manuseamento de sequências e bases de dados

3 Outubro 2024, 10:00 • Patricia Beldade

Ferramentas de análise molecular em laboratório: sequenciação de Sanger, PCR, restricção. Uso na identificação e genotipagem de polimorfismos. Desenho de primers de PCR. Identificação de sites de reconhecimento de enzimas de restricção. Mapas de restricção. Bases de dados de sequências e informações e ferramentas associadas. Ensemble (da EBI) e GenBanK (da NCBI). Procura de sequências: identidade e homologias. Acesso a vários tipos de informação genética: sequência, localização cromossómica, expressão, variantes. Exercícios de utilização do GenBank: buscas, BLAST e ORF finder.

T 05 : Análise de sequências

1 Outubro 2024, 15:30 • Patricia Beldade

Análise de sequências. Alinhamentos e polimorfismos. Distâncias genéticas. DNA barcodes: definições, propriedades e aplicações. Identificação e catalogação de espécies via técnicas de DNA barcoding. Características e exemplos de “barcodes” para diferentes grupos taxonómicos. Princípio da análise e exemplos da sua utilização.

TP 02 : Manuseamento de sequências e bases de dados

30 Setembro 2024, 14:00 • Patricia Beldade

T 04 : Sequenciação & SNPs

26 Setembro 2024, 12:30 • Patricia Beldade

Continuação da aula anterior: microsatélites. Métodos de obtenção de sequência nucleotídica. Sequenciação de Sanger (manual e automática) e NGS (introdução). Obtenção e processamento de sequências. SNPs e sua importância.

TP 01 : Introdução e alinhamentos

26 Setembro 2024, 10:00 • Patricia Beldade

Objectivos da cadeira e das aulas TP. Calendarização e avaliação. Explicação do projecto. Programa das aulas. Polimorfismos e sua origem. Formatos FASTA e FASTQ. Códigos IUPAC. Alinhamentos de sequências e identificação de polimorfismos. SNPs e indels.