Sumários

Tecnologias de sequenciação NGS de terceira geração, e montagem de genomas de referência.

10 Outubro 2024, 12:30 • Vítor Sousa

Princípios das técnicas de NGS de terceira geração (PacBio e ONT Nanopore). Resumo, revisão e comparação de técnicas de NGS de segunda (Illumina) e terceira (PacBio e ONT Nanopore) geração. Distinção entre sequenciação de novo para obter genomas de referência e resequenciação para detectar variação (SNPs) e obter genótipos. Medidas de qualidade do "assembly" de genomas: N50 e cobertura (depth of coverage).

TP 03 : Análise quantitativa e comparativa de sequências

10 Outubro 2024, 10:00 • Patricia Beldade

Estatísticas descritivas de sequências. Composição em nucleótidos ou aminoácidos. Uso de codões alternativos. Comparações de sequências de diferentes origens. Polimorfismos. Tipos de substituições de nucleótidos. Cálculo e utilidade de matrizes de distâncias genéticas. Modelos de substituições. Exercícios no programa Mega11.

Tecnologias de sequenciação NGS, RADseq e PoolSeq

8 Outubro 2024, 15:30 • Vítor Sousa

Princípio de métodos de Next Generation Sequencing e tecnologia Illumina. Passos no protocolo NGS: preparação da biblioteca genómica, amplificação, sequenciação. Aplicações de sequenciação Illumina para sequencias individuos de espécies não modelo (RADseq) e sequenciar pools de indivíduos (Pool-seq).

TP 03 : Análise quantitativa e comparativa de sequências

7 Outubro 2024, 14:00 • Patricia Beldade

T 06 : Tipos de DNA e sua utilização

3 Outubro 2024, 12:30 • Patricia Beldade

Tipos de DNA e suas propriedades principais. cDNA versus gDNA. aDNA e eDNA. nucDNA versus mtDNA. Complementaridade e princípio da sua utilização. Propriedades, vantagens e aplicações da utilização de mtDNA.